Ukończył studia filmowe w 1996 roku na Centro Universitario de Estudios Cinematográficos Państwowego Uniwersytetu, w Meksyku. W jego dorobku znajduje się kilka filmów krótkometrażowych  i wideoklipów. W 2004 roku napisał scenariusz i wyreżyserował swój pierwszy film długometrażowy “Sezon na kaczki”, który został pokazany w selekcji 43. Tygodnia Krytyki w Cannes, w 2004 roku, a także na prawie 90 innych festiwalach. Fernando Eimbcke napisał wspólnie z Paulą Markovitch scenariusz do “Lake Tahoe”.

FILMOGRAFIA
2010 Revolución
2008 Lake Tahoe / Nad Jeziorem Tahoe
2005 Perro que ladra
2004 Temporada de patos / Sezon na kaczki 
2002 La Suerte de la fea… a la bonita no le importa
1995 Perdón?
1995 No todo es permanente
1994 Disculpe las molestias